异硫氰酸异丁酯的主要用途如下：

1. 食品添加剂与调味成分

食用香料：作为合成食品香料，赋予食品特殊的辛辣风味，天然存在于芥末油、青芥辣等辛辣风味制品中。

2. 医药与农药中间体

医药中间体：用作医药合成的中间体。

农药中间体：用于农药合成，特别是作为杀虫剂的中间体。

3. 科学研究应用

抗菌研究：表现出广谱抗菌活性，用于研究其对人类病原菌（包括耐药菌）的抑制作用。

抗癌研究：具有抗癌特性，用于研究诱导癌细胞凋亡的作用机制。

抗炎研究：作为生物活性化合物，用于抗炎相关的生物学研究。