2-溴乙基异硫代氰酸酯的主要用途：

1. 生化研究工具

在生物化学领域，该化合物广泛应用于酶抑制研究、蛋白质修饰和DNA测序实验。它可作为共价抑制剂，与酶、蛋白质和核酸中的亲核位点发生特异性反应，帮助解析生物大分子的结构与功能关系。

2. 有机合成中间体

作为多功能的合成砌块，它可用于制备烷基化衍生物和杂环化合物。其分子中的异硫氰酸酯基团可与胺类反应生成硫脲衍生物，同时末端的溴原子可作为离去基团，与多种亲核试剂发生取代反应，是药物化学和材料科学中构建复杂分子的重要前体。